「ノックアウトマウス作製法にノーベル医学生理学賞が授与される」記事へのコメント

ブラックボックス

[s02222 (20350)]

>また、近年では特定遺伝子を、特定の部位もしくは特定の時期に機能消失させる
>システムも構築されつつあり、研究はより個体内での機能研究を指向したものとなってきた。

何故かスゴく馴染みのある作業に見えるんですが。この部分をコメントアウトして・・・→特定条件を満たした時にだけこのルーチンを飛ばして・・・。

Re:ブラックボックス

[Anonymous Coward]

それがリアルに実装できたことが受賞に値したわけですね。
俺らのように rem だの ; だのつけるだけじゃ済まない分野で。

Re:ブラックボックス

[SteppingWind (2654)]

実際にテープ読取装置みたいな分子がコメント配列を読み取ると, 行末配列がくるまでDNA上をテケテケと移動するようになっていたりして.

Re:ブラックボックス

[teratera (19792)]

まさしくそんなイメージです。
2006年のノーベル化学賞が真核生物の転写に関する研究 [srad.jp]でしたが、転写は特定のDNA配列部分から始まり、特定の配列まで読み込みます。

更に、途中で読み飛ばす配列（イントロン）や、タンパク質へ翻訳する場所の選択などもDNAの配列に依存するようです。
遺伝情報として引き継がれるのは基本的にDNAだけなので、DNAによっていろいろと作用が規定されているのは判ります。
でも、『具体的に何をやっているか』ってのは、まだまだ判ってなくて、そういうことの解明にノックアウトマウスとか使われてます。

Re:ブラックボックス

[kaho (2741)]

ご存じかとは思いますが、補足的に。
＞途中で読み飛ばす配列（イントロン）
イントロンは読み飛ばされるわけではなくて、エクソンと一緒に一続きで読み込まれて、あとで要らないからと切り出され [wikipedia.org]ます。
ソースコードに書かれたコメントがコンパイル時に無視されるようなものかな？

＞転写は特定のDNA配列部分から始まり、特定の配列まで読み込みます。
これも必ずしもそうとも言えなくて、配列以外にDNAやヒストンの修飾にとても強く依存します。
環境変数によってバイナリの変わるマクロとかpragmaのようなもの・・・というとちょっと強引かも。

また転写開始点も必ず同じ場所から始まるわけでもなかったりします。mainから始まるわけではない [hatena.ne.jp]みたいな・・・

--
kaho

Re:ブラックボックス

[pmjames (29210)]

もとのコメントはCre-loxPなどを用いたコンディショナル・ノックアウトのことを指していると思うので、
/* と */ (それぞれ34文字のloxP配列)で囲まれた部分が(Cre の発現で)読み飛ばされる、といったイメージではないかと思います。

# DuPontのライセンス契約書見たことあるけど、IDでいいや。

Re:ブラックボックス

[Anonymous Coward]

先週末に、セレラ社が「ゲノムを切りつめた最小ゲノム」の人工合成に成功した事を間もなく発表するという報道が流れた（インタビュー記事として）

「Mycoplasma genitalium」のゲノムの1/4分（58万塩基対の遺伝情報を含む381遺伝子長のゲノム）らしいけれど、細菌のゲノムの切り張りじゃなく合成ゲノムになる。で、あれが実際に増殖可能なら、「母胎になる細菌の細胞に移植すれば、栄養素を取り込んで生命活動を開始する最小ゲノム」になるらしいんだけれど、それはどういう位置づけになるものなの？

Re:ブラックボックス

[Anonymous Coward]

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