パスワードを忘れた? アカウント作成
この議論は賞味期限が切れたので、アーカイブ化されています。 新たにコメントを付けることはできません。

細菌のゲノムを人工的に合成することに成功」記事へのコメント

  • by Anonymous Coward on 2008年01月27日 12時52分 (#1287299)
    DNAなんてとうの昔から、材料を投入して塩基配列を
    指定すると自動合成できるものだと思ってました。
    「DNA合成装置」でぐぐるといっぱい出てきますし。

    長さが問題みたいですね。自動合成できるのは
    せいぜい数十配列くらいまでみたい。でも、数十配列で
    あっても可能なのだから、原理的には長いのもできるはず
    のような気がします。今回の研究の、どこがすごいのでしょうか。

    人工生命を実現するには、あとはDNAの適切な箇所が適切な
    タイミングで働くような環境が必要ですが、こっちのほうが、
    人工的に作るのは難しそうな気がします。今回の研究で
    ソースコードは用意できたけど、実はコンパイラがない、
    といった感じでしょうか。もしこれができたら、死者を
    復活させることができるかも。(単細胞生物限定だけど)。
    • by Anonymous Coward on 2008年01月28日 1時33分 (#1287444)
      DNA合成って、1本のDNAを合成するんじゃないんですよ。
      例えばある"ACGTCATGCAGCAGCTGGGTGACATGTACGACACA"って配列を作りたかったら1文字ずつ合成するんですけど、 たとえば1000万本とかを一気に作るわけです。仮に、1文字分を合成する成功率がめいっぱいがんばって 99% だったとしても、最後まで合成が上手くいくのは 0.99^(文字数) = 約70% なわけで、最後まで上手くいっているのは700万本しかないわけです。長いものになるとゴミの割合がどんどん増えていきますので、実験に使う前には精製をして純度を高めてから使います。
      文字数がどんどん長くなってくると果てしなくゴミばかりになり、目的の配列を持ったヤツがなくなってくるので普通の(所謂DNA合成装置を使った)DNA合成では難しいわけです。
      今回の研究はDNA合成装置で作った短いDNAをつなぎ合わせて長いDNAが合成できました、というのがキモです。つなぎあわせるといても、一般的な方法があるわけではなくてある意味職人芸的にやったわけですが、まぁ、とにかく実際に作ったわけで、同じ手法で原理的には150万塩基対ぐらいまでなら無理ではないことが示せたのが偉いところです。
      親コメント
    • by SteppingWind (2654) on 2008年01月27日 21時05分 (#1287385)

      言い換えれば

      1. ソースプログラムは一式そろっている.
      2. クロスコンパイラで個々のサブルーチンは出来ている
      3. ちょっと怪しげだけど, リンクしてOSカーネルが出来たみたい←今ここ
      4. ターゲットのハードをどうやって作ったらいいのか, よく分からない(似たような構成のにインストールしてみる?)
      5. どうすればブートするんだろ?

      って感じかな.

      親コメント
      • by Anonymous Coward on 2008年01月27日 22時36分 (#1287409)
        DNAを動作させるための機構も、もとをただせばDNAの遺伝情報からできているので、
        鶏と卵の関係みたいなものですね。

        生きている細胞からDNAを抜き取って、即座に(DNAを失った細胞が死なないうちに)、
        人工的に合成したDNAを入れてやれば、たぶん動くんだろうけど、でもそれだと、
        生命の人工合成とは呼べない気がする。

        DNAを失った細胞がすぐに死んでしまうのは、おそらく、細胞を構成するタンパク質は
        どんどん壊れていったり消費されていったりするので、絶えず新しいタンパク質を
        補充しないといけないからだろう。そうすると、それらの、壊れやすいタンパク質を
        「いっせーのーで」で用意して所定の構造に組み上げると同時に合成DNAを投入して
        やらないといけない、ということになるのかな。

        なんだか、生命って、数十億年前の誕生以来、脈々と受け継がれてきているのだなあ、
        という感じがします。あたりまえかもしれないけど。そう考えると、最初に書いた鶏と卵
        というのは、例え話ではなくて生命そのものを示した言葉ですね。
        親コメント
      • そんなにできてるでしょうか。

        1. ROMの内容は吸い出した(ただしランダムな断片しか吸い出せない)
        2. ファイルシステムを解析して一通りプログラムっぽいもののコピーをそろえた
        3. 元のROMのイメージを再構成した←現状
        4. プロセッサはどうやって作ったもんだか(1950年の技術水準で)

        ってところじゃないでしょうか。

        ゲノムなんて基本は4進法デジタルデータです。「生物」の人工合成とか考えるなら、問題はウェットウェアの分子機械のほう。これをフルスクラッチするのは、ちょいとばかりホネでしょう。

        --
        Jubilee
        親コメント
    • 赤ちゃんにマラソン完走してみろって言っているようなもんだ。

      # 大阪国際女子マラソン中なので、AC
      # 府知事選にも行きましょう
      親コメント
      • by Anonymous Coward on 2008年01月27日 20時13分 (#1287376)
        > 赤ちゃんにマラソン完走してみろって言っているようなもんだ。

        一般論としていろんなものの能力には限界があることもある、
        ということは分かっているのですが、なぜ限界があるのか、
        という理由はそれぞれ違うことがあります。

        赤ちゃんがマラソン完走できない理由と、現在のDNA合成装置に
        細菌のゲノムが作れない理由は、どのへんが似ているのでしょうか。
        親コメント
    • by Anonymous Coward
      そういえば単細胞ってみんな同じDNAなのかな?
      同じだとしたら、実は皆同じ存在?同じ条件で同じように動くとか。
    • by Anonymous Coward
      1m走ってマラソンのなんたるかを語ってるようなものですな。
    • by Anonymous Coward
      >今回の研究の、どこがすごいのでしょうか。

      論文中に開発した手法の概要から何がすごいのかまで簡単に書かれてますから、読んでみると
      いいんじゃないかと思いますが。Scienceなら一般の人も割と簡単に入手できますし。

ハッカーとクラッカーの違い。大してないと思います -- あるアレゲ

処理中...