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産総研がOpteron 2116個のLinuxスパコン導入へ」記事へのコメント

  • クラスターでのボトルネックはやはりネットワークだと思うんですがネットワークは何使うんですかね?で、システムを組むとき重要なのは何を計算するかだと思うんですが計算対象としては何を想定してるんですかね?
    某研究所のたんぱく質のシミュレーション用にPCク
    • 既に出ていますが、Bandwidthで以下のような成績です。
      仮にそのソフトをその設定で使ったとしても、1000Baseなら30台、Myrinetなら100台以上いけることになります。
      まあ実際には設定次第でもっと行けるというか、行っているところがありますので・・・

      Myrinet2000 64bit 200MHz
        -230MBytes/s
        ノード単価 30~45万円

      Myrinet2000 64bit 133MHz
        -170MBytes/s
        ノード単価 25~40万円

      1000Base-T
        -60MBytes/s
        ノード単価 2~10万円

      100Base-TX
        -10MBytes/s
        ノード単価 0.1~3万円
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