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高性能計算の話をする人であれば、
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皆さんもソースを読むときに、行と行の間を読むような気持ちで見てほしい -- あるハッカー
クラスターのボトルネック (スコア:1)
某研究所のたんぱく質のシミュレーション用にPCク
Re:クラスターのボトルネック (スコア:0)
> まさか素人みたくネットワークを考えないでPCの2116倍性能が
> でますとは言わないだろうし。
言わないだろうね。
ってか、そんなの心配するのあなただけでは?
光ファイバ使って10Gbps出せる御時世ですよ。
Re:クラスターのボトルネック (スコア:1)
が、#369475さん [srad.jp]は知らないのかも知れませんがスパコンの世界では一般的に1TFLOPSの性能を出すのに1Tbpsのネットワークが必要であるといわれています。
PCクラスタを組む場合、ネットワークがどうしても制限をうけてしまうのである特定の計算に特化したシステムを組むことで汎用性を犠牲にします。これはPCの数が増えれば増
Re:クラスターのボトルネック (スコア:2, 参考になる)
高性能計算の話をする人であれば、
Re:クラスターのボトルネック (スコア:1)
> ・ 今さら100Base-TXでの事例なんて引合いに出さない
この考え方がどの辺から来てるのか分かりませんが、これまでスパコンを使っていた分野でもこれからはPCクラスタを使って計算しようというのが流行っています。計算のモデルとチューニングによってはネットワーク速度がそこまで必要ないものも有り、100Base-TXでスケールするものであれば100Base-TXで組んだPCクラスタで大規模計算をやっています。そもそもPCクラスタでやろうというのはコストを抑えようというのが大きいので安ければ安いに越したこと無いですしね。
Re:クラスターのボトルネック (スコア:1)
最後ぐらいしか(ちょっと語弊があるけど)ネットワークに負荷を
かけませんから、計算性能は台数効果を出せますがそりゃ当たり前。
それに、「あるソフトは100-TXだと5台でサチった」というのであれば、
じゃぁとりあえずギガビットイーサにすりゃいいじゃん、の一言で済ま
せられちゃいます。今時そんなに高くないんだから。今だとマザーボード
に搭載されていたりしますから、ますます100-TXという選択はありえなく
なってきていると思いますよ、1000ノード超という規模であれば。
(「音響カプラは止めといた方がいい」と言われているようなもんです)
「グリッドのそもそもの思想は単一の計算を膨大な数のPCでやろうというもの」
は間違いです。(computational)グリッドは電力網のアナロジーから
名付けられたもので、計算資源(CPU・メモリ・ストレージ・データ)を
電力網のようにどこからでも手軽に使えるインフラストラクチャとして
提供しよう、という発想です(だから"grid")。従って、グリッドを
対象にした計算資源(計算機)であれば、その資源が多様な目的で使用
される事が大前提なのです。もっとも、フルノードを時分割的に使わせ
るか、CPUを切り売りするように使わせるかは運営によるので、「フル
ノード同時使用は想定されていない」と断定するのはいき過ぎでしたが、
2000CPU規模の並列計算を効率良くこなせるソフトウェア(OS・ライブラリ・
アプリケーション)はそんなにない以上、切り売り式が普通の運営形態に
なるんじゃないかと、思います。件のクラスタがどう運営されるかは
まったく知らないので、これは憶測ですが。
最後の「1TFLOPSの性能を出すには1TByteのメモリ、1Tbpsのネットワークが必要」
ですが、これはなるほどですね。地球シミュレータの場合、
36TFLOPSで10TByte、ネットワークはノード間が16GB/sのクロスバー
スイッチですから、ざっといって10Tbpsのオーダにはなりますね。
Re:クラスターのボトルネック (スコア:0)
考えることに時間を使ったほうがいいとおもうよ。