パスワードを忘れた? アカウント作成
この議論は賞味期限が切れたので、アーカイブ化されています。 新たにコメントを付けることはできません。

遺伝子拡張:6種の塩基でタンパク質合成に成功」記事へのコメント

  • この研究は (スコア:3, 参考になる)

    いままでSFや先端分野の研究者では可能性が論じられてきていましたが、
    まさか本当に実現できるとは思ってもいなかったので大変にすばらしい
    研究といえるでしょう(ノーベル賞級?)。
    現実の生物は通常4塩基の組合せで20種類のアミノ酸と1つの開始信号、
    3つの停止信号をコードしていますが、6種類の組合せだと最大でおよそ
    1000通りのアミノ酸をコードできることになります。

    生体のなかにはタンパクには通常使われないアミノ酸も多いことから、
    暗号を縮合して適切なtRNAのセットを新しく作れば、アミノ酸生合成系を
    大きくいじらなくてもタンパクさせることは十分に可能だ
    --
    Eureka !
    • by Anonymous Coward
      6種類の組合せだと最大でおよそ1000通りのアミノ酸をコードできる
      1000通りですか?
      • >1000通りですか?

        間違ってましたね(^^)。

        正しくは216種類-α。

        #αは非翻訳暗号の分です。
        --
        Eureka !
        • まー、今の段階(ATGC)で、トリプレットには
          4^3=64パターンあるわけですが、それに対応する
          アミノ酸は20種類。

          それに開始コドン、終了コドンがありますから、単純に
          数字だけ比較すれば、70種類程度ってことになり
          • 逆の考え方もあるかも。

            >今まで20種類だったREGOブロックがもし70種類になったなら、

            今まで20種類だけ摂ればよかった必須アミノ酸を、6種塩基の生物は
            生存のために、最大で70種も摂らなきゃならないわけですね?
            ・・・・自分で作り出せないアミノ酸があると、すごく生き
            --
            ---- redbrick
            • あー、目を見開かされたコメント。

              ところで、体内で合成できるかどうかもポイントだと
              思うのですが、そういう仕組みを高度に有する生物は
              考えられないでしょうか(汗)?
              • ある程度自立的に自己複製しつつ増殖できるという生物の特性を考
                えれば、食糧として取り込むことができないアミノ酸は自分で合成
                する必要があります。

                当然のことですが、たとえば70種類のアミノ酸全てを合成するとして、
                それを70種類のアミノ酸を組み合わせて作られる酵素タンパクでどの
                ように実現するか?

                20種類のアミノ酸を組み合わせたものの立体構造を推測することも
                まだまだ完全ではないのに、道のりはかなり遠そうです。

                さらに、増えた分のアミノ酸を合成することには余計にコストを取
                られるわけで、それだけの投資からどんな見かえりをその生物が
                受け取れるのか、はなはだ
                --
                Eureka !
              • 6塩基生物の話はSFになるので、僭越ながらパス。

                (たとえば)Cell Free系でタンパク質を作るときなんか、
                アプローチにはおおまかに二通りあって

                理学的手法:
                まずは立体構造から構造と活性の相関を調べ、反応の本質を
                結論付ける。
                (構造活性相関を演繹的に求める)

                工学的手法:
                片っ端からいろんな物質の誘導体を作って(オリジナルを微妙に
                モディファイしたものを何通りも作成して)片っ端から試験して
                活性の高い物質を得る。
                (構造活性相関が帰納的に求められる)

                で、この場合、たとえば工学的手法において、
                「ああ、この酵素の、この部分の電子密度をあとちょっと
                高められれば活性上がるかもなぁ…
                でも、そんな高い電子密度を持つアミノ酸ないし…」

                なんてときに、新たな手法になる(かもしれん)わけです。

                あ。当然ながら、70個のアミノ酸をコードできたとして、
                70個すべてのアミノ酸を使う「必要」なんてありませんからね。

                4^3=64パターンあるコドンが、なんで20個しかアミノ酸を
                コードしてないかなんてのは、それこそrRNAに聞いてみないと
                わかりませんが(^^;
                アミノ酸とRNAのinteractionがあまりにもstrictになると
                エラーが頻発してしまうからかもしれませんね。
                親コメント

日本発のオープンソースソフトウェアは42件 -- ある官僚

処理中...