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UNIXはただ死んだだけでなく、本当にひどい臭いを放ち始めている -- あるソフトウェアエンジニア
検索専用とは (スコア:0)
Re:検索専用とは (スコア:0)
遅すぎて使う意味ないかも。
960Mbase/secってせいぜい0.5GB/secでしょ。
オンメモリならPCレベルにもなってない。
Re:検索専用とは (スコア:1, 興味深い)
日本語で書くと、9億6千万塩基対/秒。
絵的に描くと、
ATCGGTTC…
|||||||| to 9億6千万pair。
TAGCCAAG…
因みに、塩基配列で言う所の検索とは、同一物を探してくるのでななく、類似物を探してくるので、通常のDBと同等に考えてはいけない。ような気がする。
クエリー配列には余計なギャップが含まれていることもあるし、色々な事情で紛らわしい配列もある。良く分からん配列もある。AともCとも言えぬ配列もある。
そんなんで色々と大変。なような気がする。
じゃあ、300Mbase/4秒は早いのか。
実をいうと、良く分からない。
私の斜め横に、PC
Re:検索専用とは (スコア:1, 興味深い)
> 日本語で書くと、9億6千万塩基対/秒。
A,G,C,T の 4 種類だから、 1base は最大 2bit ですね。
偏りがあればもっと小さくなるけど。
Re:検索専用とは (スコア:1, 参考になる)
undefined的なものもあるわけなんで,
もう数ビットは少なくともいるんじゃないでしょうか.
Re:検索専用とは (スコア:1, 参考になる)
メチル基は特定の遺伝子が使われないようにする目的でくっつけられているのではないかと考えられています。突然変異や世代交代を待たずに使用する遺伝子セットを切り替ているわけです。