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あと、僕は馬鹿なことをするのは嫌いですよ (わざとやるとき以外は)。-- Larry Wall
見出しで誤読 (スコア:1, 興味深い)
Re:見出しで誤読 (スコア:2, おもしろおかしい)
Re:見出しで誤読 (スコア:2, 興味深い)
4秒?全然遅いじゃん(嘲笑)
# 最速じゃなくて平均値言ってみろよ、と思うAC
Re:見出しで誤読 (スコア:1, 参考になる)
index化しづらいデータ構造な気がするんですが。こういうのってトークンに区切れる文章や、一般的なRDBに対するクエリと全然種類が違うと思うんですが、どうなんすかね。
そんな簡単に比べられるんですかね?
Re:見出しで誤読 (スコア:0)
識者の方、間違っていたらご指摘ください。
Re:見出しで誤読 (スコア:2, 参考になる)
例えば全体の90%が一致=10%が異なっているのを「高い相同性」という世界です.
http://www.ddbj.nig.ac.jp/search/archives/blast_doc-j.html [nig.ac.jp]
MD5のような方法でのインデックス化は無理です.
Re:見出しで誤読 (スコア:1, 興味深い)
ただし、ゲノム検索の目的はexact matchを求めることではなく、
# このため、インデックス化をいかに効率よく実現しても、顧客情報の検索のようにはうまく行きません
ある類似度を基準としたmatchingなので、データ構造以外のアルゴリズムも速度と精度を高める上で重要です。 より早く、より高い感度で、が求められてる世界ですね。