strmのコメント: Mathematicaのノートブック (スコア 1) 94
数式のノートを取るだけならMathematicaのノートブックがおすすめです。
(言語としてのMathematicaでなく、単にノートブックインターフェース部分)
ショートカット(例えばべき乗ならCtrl+^, 入力後Ctrl+Spaceで抜ける等)を覚えれば
かなりの速度で入力できて、かつリアルタイムに綺麗な数式を得ることができます。
個人的にはラップトップでノートを取る利点を見出せないので、この用途に使ったことはないですが。
ノートを文字通り単なるメモとしてとらえてるか、自分に必要な情報を集約するものとして
とらえてるかの違いでしょうか..