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有償でよければ LEDA [algorithmi...utions.com]や yFiles [yworks.com]が あります.住商エレクトロニクスが代理店をやっているっぽいです.
ところで,graphViz って複雑なグラフを描こうとすると, 極端に遅くなりませんか? 酵母の遺伝子間相互作用をグラフ化しよう としてハマりました
ノード数が1000を超えるあたりから、既存のツールはボロボロ脱落して いきますね(応答性という観点では)。 私の場合はTouchGraph [touchgraph.com]が候補 だったのですが、1000~2000ノードは出したいという要求には合いませんで、 結局自分で作りました。ブロック分割してカットオフするなど、 いろいろ盛り込みましたが、そろそろSMPマシン向けに、計算を分割する事を 考えねばらならない状況です。
もっとも、あらかじめグラフを階層化するなどして、 グラフの(描画)密度を下げるなどの前処理がやはり不可欠です。 私の場合、4000万ノード→100万ノードにクラスタリング→ 1000ノード程度の部分グラフを抽出、といった形をとっています。
参照先: Web Community Browser [titech.ac.jp]
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アレゲはアレゲ以上のなにものでもなさげ -- アレゲ研究家
グラフ可視化ソフト (スコア:5, 参考になる)
ネットワーク図の出力だけではなく、
一般のグラフの可視化ソフトとしてとても優れたソフトです。
配置も賢くて、ちょっとノードのグルーピングをしてあげれば
ほぼ望んだようなグラフが出てきます。
表示例 [att.com]の画像をクリックするとテキストのソースが表示されますが
とてもシンプルで最初に見たときには驚きました。
他にフリーで入手可能な同種のツールとしては
Re:グラフ可視化ソフト (スコア:1, 参考になる)
有償でよければ LEDA [algorithmi...utions.com]や yFiles [yworks.com]が あります.住商エレクトロニクスが代理店をやっているっぽいです.
ところで,graphViz って複雑なグラフを描こうとすると, 極端に遅くなりませんか? 酵母の遺伝子間相互作用をグラフ化しよう としてハマりました
Re:グラフ可視化ソフト (スコア:1)
png や gif 出力などのレンダリングが必要なものでは非常に遅くなりました。
そういうときは size を指定するといいのかもしれません。
なお、ps 出力では 2500 ノードの疎なグラフならサイズ無指定でもまったく問題なく出力できてます。
もっとノード数の桁が上がると使えなくなるのかもしれませんが……
Re:グラフ可視化ソフト (スコア:1)
ノード数が1000を超えるあたりから、既存のツールはボロボロ脱落して いきますね(応答性という観点では)。 私の場合はTouchGraph [touchgraph.com]が候補 だったのですが、1000~2000ノードは出したいという要求には合いませんで、 結局自分で作りました。ブロック分割してカットオフするなど、 いろいろ盛り込みましたが、そろそろSMPマシン向けに、計算を分割する事を 考えねばらならない状況です。
もっとも、あらかじめグラフを階層化するなどして、 グラフの(描画)密度を下げるなどの前処理がやはり不可欠です。 私の場合、4000万ノード→100万ノードにクラスタリング→ 1000ノード程度の部分グラフを抽出、といった形をとっています。
参照先: Web Community Browser [titech.ac.jp]