「siRNAでヒトの乳がん細胞の増殖を制御することに成功」記事へのコメント

全然違う……

[y_tambe (8218)]

いくら何でも、この読売記事はひどいよorz

今回、NatureのAOP [nature.com]に出たのは 「Induction of DNA methylation and gene silencing by short interfering RNAs in human cells」　単なるsiRNAの話ではなくて、CpG islandをターゲットにしたsiRNAによってDNA methylationによるgene silencingを哺乳細胞で可能にしたという報告なのです。

従来のsiRNAによる遺伝子発現抑制は、発現したmRNAに相補的なsiRNAが結合することでそのmRNAが分解され、結果として発現抑制されるという原理で、この実験系はノックアウト生物の代替手法としてほぼ確立された（されつつあ

かつてアンチセンスmRNAといわれる技術が

[Be amphibious (22485)]

かつて植物バイオの世界でもアンチセンスmRNA法といわれる技術があって、日持ちのするトマト「フレーバーセーバー」なんてのがこの方法で作られていた。ある蛋白質をコードするmRNAに対して相補的な配列をもつRNAを遺伝子組み替えで作らせる。するとそのmRNAを元にしてできるはずの蛋白質ができなくなる。フレーバーセーバー・トマトは細胞壁分解酵素を抑えていたっけ。 それは現在RNAiと呼ばれる現象だと後に判明。当時はアンチセンスmRNAのメカニズムは不明で、相補鎖形成による翻訳阻害が原因なんて言われていた。しかし対象となるmRNAが分解されることは知られており、一部にDNAメチル化によるmRNAの転写阻害があるかも、と言われていた。

それがホントにあったのね。

Re:かつてアンチセンスmRNAといわれる技術が

[y_tambe (8218)]

いや、アンチセンスの方は、むしろsiRNAと類似の機構だと考えられているのでは？
今回はCpG islandのDNAメチレーションを制御する場合で、mRNAにコードされない部分を標的にしてます。それに対してアンチセンスはあくまでmRNAに相補的なものを使うわけで。

アンチセンス一本鎖RNAが細胞内に取り込まれて相補的なものと結合して二本鎖になると、ダイサーという酵素によって切断されて20mer以下になり、結果的に２本鎖siRNAができるという機構があることが見つかってますし。

ついでにいうと、２本鎖の長いRNAだとでも原理的には同じことがおきそうに見えるんだけど、その場合、高等生物ではインターフェロン応答というものが同時に起こって、すべての転写が非特異的に抑制されます。この応答は元々、ウイルス感染が起きたときに細胞がα／β－インターフェロンを産生して全転写を抑制し、ウイルスタンパクの合成を止めることで生体を守ろうとする機構で、このため、特定配列を特異的に抑制するということは出来なかった。ところが20mer前後のsiRNAでは高等生物でもインターフェロン応答を起こさずにRNAiが起こせることが判った、という経緯があります。

長いアンチセンスRNAが高等動物で使えないとは！

[Be amphibious (22485)]

実は長いアンチセンスRNAが高等動物で使えないというのが寡聞にして初耳。調べてみたら本当ですね。ショウジョウバエのごとく普通にRNAiが出来るものと思いこんでました。なるほど。情報に感謝します。

あとアンチセンス法と転写抑制の話ですが、RNAi以前のアンチセンス法でも非翻訳領域やゲノムDNAの部分配列を用いる場合があったと記憶。この時に配列中に含まれていた非コード領域が断片化して核に到達→今回の報告のように働いて転写抑制に至ったのかな、と憶測したわけです。はい。