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DNA職人の朝は早い。「最近はM13使ったりする人が多いけど、手作作業にこだわるお客さんがいるからね」そう言って、繊細なてつきでDNA鎖の加工を始める。「調子がいい時はね、触った感触でATGCの区別が付くんですよ。そういう時はこの仕事をやっててよかったと思いますね。」そう言って笑った職人の手には、見事なDNA折り鶴が乗せられていた。
いつものごとく詳しい人がこれによってなにがすごいのか詳しく教えてくれるのを待ってたら現れず沈んでしまうパターン
DNA折り紙ってのは，環状の紐をいい感じに折り曲げていって，様々な平面形状（や，その平面をそれこそ折り紙のように折りたたんでできる立体）を作る技術です．
まず，長い環状のDNAを考えます．その中に，ある場所にある配列[a]と，別の場所に違う配列[b]があったとしましょう．DNAを作っている塩基はペアになる塩基と特異的に結合しますから，この[a]にぴったりくっつく[a']という配列や，[b]にぴったりとくっつく[b']という配列を考えることができます．
さて，[a']-[b']という配列を持ったDNAの断片を用意して，環状のDNAと混ぜて放置したらどうなるでしょう？断片中の[a']は環状DNAの[a]にくっつき，断片の逆側の[b']は環状DNAの[b]にくっつきます．すると，環状DNAに注目すると，[a]の部位と（離れた場所にある）[b]の部位が糊付けされたようにくっつくこととなります．これを多数の箇所で行うことで，「輪っか」を無数に糊付けして出来上がる「平面形状」を作り上げることができるわけです．これがDNA折り紙となります．さらにこの手法は平面に限らず，立体も作成可能です．たとえば立方体の展開図のような平面形状を作っておいて，辺と辺とを結び付ければ面が組みあがって立体になるわけです．
例えばどんな構造ができるかはこちら．http://www.chem-station.com/blog/2014/06/dna-5.html [chem-station.com]http://www.chem-station.com/blog/2014/08/dna-6.html [chem-station.com]http://www.chem-station.com/blog/2014/08/dna-7.html [chem-station.com]
でまあ，こんなふうに望んだ構造を自由に作れたり，さらにその構造の特定の場所に任意の置換基を組み込んで機能を発現させたりできるわけですが，非常に複雑だったり，結構大きい構造を作ろうとすると，当然ながら用いる環状DNAが大きくないといけないわけです．しかしながら，完全に設計されたDNAの大きいものを作る，ってのはなかなか難しく，そのためDNA折り紙で作れるサイズ（や，複雑さ）にも限界があるよ，と．で，今回の報告は，「今までより大きい環状DNAを量産できるようになったから，もっと複雑だったり大きい構造もDNA折り紙でいけるよ！」という感じ．
なおDNA折り紙に関しては，「任意の平面構造などを入力すると，必要となる塩基配列に変換してくれるオープンソースのソフトウェア」なんてのもあったりします．「こういう構造を作りたい！」ってのが決まっていれば，どんなDNAを持ってくれば良いかがすぐわかって便利．
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UNIXはただ死んだだけでなく、本当にひどい臭いを放ち始めている -- あるソフトウェアエンジニア
コメントがないな (スコア:1)
DNA職人の朝は早い。
「最近はM13使ったりする人が多いけど、手作作業にこだわるお客さんがいるからね」そう言って、
繊細なてつきでDNA鎖の加工を始める。
「調子がいい時はね、触った感触でATGCの区別が付くんですよ。そういう時はこの仕事をやっててよかったと思いますね。」
そう言って笑った職人の手には、見事なDNA折り鶴が乗せられていた。
Re: (スコア:0)
いつものごとく詳しい人がこれによって
なにがすごいのか詳しく教えてくれるのを待ってたら
現れず沈んでしまうパターン
Re:コメントがないな (スコア:1)
DNA折り紙ってのは，環状の紐をいい感じに折り曲げていって，様々な平面形状（や，その平面をそれこそ折り紙のように折りたたんでできる立体）を作る技術です．
まず，長い環状のDNAを考えます．その中に，ある場所にある配列[a]と，別の場所に違う配列[b]があったとしましょう．
DNAを作っている塩基はペアになる塩基と特異的に結合しますから，この[a]にぴったりくっつく[a']という配列や，[b]にぴったりとくっつく[b']という配列を考えることができます．
さて，[a']-[b']という配列を持ったDNAの断片を用意して，環状のDNAと混ぜて放置したらどうなるでしょう？
断片中の[a']は環状DNAの[a]にくっつき，断片の逆側の[b']は環状DNAの[b]にくっつきます．すると，環状DNAに注目すると，[a]の部位と（離れた場所にある）[b]の部位が糊付けされたようにくっつくこととなります．
これを多数の箇所で行うことで，「輪っか」を無数に糊付けして出来上がる「平面形状」を作り上げることができるわけです．これがDNA折り紙となります．
さらにこの手法は平面に限らず，立体も作成可能です．たとえば立方体の展開図のような平面形状を作っておいて，辺と辺とを結び付ければ面が組みあがって立体になるわけです．
例えばどんな構造ができるかはこちら．
http://www.chem-station.com/blog/2014/06/dna-5.html [chem-station.com]
http://www.chem-station.com/blog/2014/08/dna-6.html [chem-station.com]
http://www.chem-station.com/blog/2014/08/dna-7.html [chem-station.com]
でまあ，こんなふうに望んだ構造を自由に作れたり，さらにその構造の特定の場所に任意の置換基を組み込んで機能を発現させたりできるわけですが，非常に複雑だったり，結構大きい構造を作ろうとすると，当然ながら用いる環状DNAが大きくないといけないわけです．しかしながら，完全に設計されたDNAの大きいものを作る，ってのはなかなか難しく，そのためDNA折り紙で作れるサイズ（や，複雑さ）にも限界があるよ，と．
で，今回の報告は，「今までより大きい環状DNAを量産できるようになったから，もっと複雑だったり大きい構造もDNA折り紙でいけるよ！」という感じ．
なおDNA折り紙に関しては，「任意の平面構造などを入力すると，必要となる塩基配列に変換してくれるオープンソースのソフトウェア」なんてのもあったりします．
「こういう構造を作りたい！」ってのが決まっていれば，どんなDNAを持ってくれば良いかがすぐわかって便利．