「数十万人のDNAから人類の歴史の旅を辿る」記事へのコメント

どのくらいすごいのか？

[flutist (16098)]

まさか各サンプルのすべての配列（30億塩基対）を読み出すわけじゃないだろうから、各人のゲノムのごく一部を読んで解析するんでしょうけど、どこを読むかだけでも議論の的ですね。各個人で異なる場所やその頻度の特定にも一役買ってくれるかもしれません。

もしj

Re:どのくらいすごいのか？

[rainforest (4616)]

個々人で異なるほど多型性の高い領域は使わないと思いますよ。
そういう領域は、変異が飽和(saturate)してて系統推定には向かないです。

まあ、ふつーに考えたらミトコンドリアを使うんじゃないですかね。
D-loopを含む領域かな。

# 出来れば核ゲノムは避けたいですよね。ミトコンドリアの多型性が
# 低い場合には核ゲノムを使わざるを得ないですけど。
# そう言えば、だいぶ以前にマイクロサテライト領域の対立遺伝子頻度
# で、人類の系統を書いた論文がNatureにのっていましたね。それなりに
# 大陸毎にまとまっていた記憶があります。今回の数十万人とは規模が
# 違いましたけど。