「ゲノムの塩基数が最少の細菌が発見」記事へのコメント

遺伝子数１８２

[flutist (16098)]

遺伝子の数だけ見ると、これぐらいならゲノムを設計できるんじゃないか、という気がしてきます。

妄想は飛ぶけど、細胞の外部に必要となる環境がどの程度シンプルか、によっては実際に設計するためのヒントが得られるかも。

Re:遺伝子数１８２

[M-FalconSky (8868)]

そうですね。

ただ、共生関係とのことで、いろんな必須機能を相手が提供してくれる前提でシェイプアップしているかもしれまんから、なかなか難しいかもしれません。

# それでも、これくらいならDNAシーケンサー?で1発で生成できそう...

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M-FalconSky (暑いか寒い)

Re:遺伝子数１８２

[shimotsuki (2505)]

DNAシーケンサは塩基配列を読む機械ですよ。合成するのはDNAシンセサイザ。でもそんな長いの作れないんじゃないですかね。

ゲノムサイズが小さいといっても別の生物と共生関係を結んでいる細菌ですから、ミトコンドリアだってそのようにみなすこともできるわけで、そうするとせいぜい2万塩基対しかないので圧勝ですね。なんだ、全然すごくないやん、と私なんかは思ってしまいますね。独立した生活を営んでいる細菌でやってくれないと。

Re:遺伝子数１８２

[kaho (2741)]

＞でもそんな長いの作れないんじゃないですかね。

Craig Venterのところでは既に5,386塩基のバクテリオファージの合成に成功 [venterinstitute.org]
してますからそれから３年ということも考えると無理とはいえないのではないかと．
これくらいの長さになるとシンセサイザーは短い断片を作るだけに用い，PCRでつなげて
いくようです．

ここはSynthetic Biology [nature.com]を大きなターゲットにしていますので，バクテリアゲノムの合成もやろうと
していることは間違いないと思います．
既存のバクテリアをトランスフォームすればいいじゃないかという気もするのですが，完全にコントロールした
状況で新薬や化学物質の合成に使いたいのだそうです．

また，Nature Web News [nature.com]の記事ですと，この研究と同時になってしまったので残念だった，
同じく小さなゲノムサイズのバクテリアを報告したグループの研究者は「人工的に合成できるほど小さい」と
コメントしています．

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kaho