「簡易SNP検査で治療法をオーダーメイド」記事へのコメント

SNPsの原理

[y_tambe (8218)]

SNPsの原理については、 ここ [k-eng.co.jp]や、ここ [gls.co.jp]あたりが判りやすいかな。

読売新聞の見出しだと「血液１滴」が強調されてて、なんか血液を直接塗抹して検査できそうな誤解を与えかねない気もするんですが (^^; そこは要するにPCRの材料としては血液１滴で十分だということで、これは別に従来の方法と何ら変わりがないわけで、この研究の目玉ではないでしょう。

詳しい方法については、元記事からだけだと判りませんが、おそらく原理的な部分ではあまり違いがないんじゃないだろうかと思います。多分、血液などから目的のSNPを含む遺伝子断片をビオチンか何かで標識したプライマーで増幅して、あらかじめプラスチックに付着させてお

Re:SNPsの原理

[gatekeeper (18246)]

分子生物学は完全に素人ですが、最初にPCRが入ると
（つまり、単に増やすだけのPCRだと）２時間・400円は厳しくないですかね。
というわけで、ここはプライマーとPCRのかけ方に何か細工をして、
SNPが普通と違うとPCRで増えないとかだと見ました。
個人的期待としては謎の生物由来(たいてい菌だけど)の謎の酵素とか。
# まぁそうだとすると最初の応用がSNPの検出ではないと思いますが。

あと気になるのは血液中の細胞の

Re:SNPsの原理

[kaho (2741)]

＞２時間・400円

最近はサーマルサイクラーの性能もよくなっていますし，試薬の値段も
下がっているのでこれはいけると思いますよ．
SNP領域としては100-500塩基くらいの長さをとるはずなので一回の
増幅時間は30秒もあれば十分でしょう．x20してほかの時間を入れても
１時間ちょっとじゃないでしょうか．

＞リンパ球はともかく、白血球は核が変な感じになってる場合が多いので
＞ちょっと気持ち悪い感じがします。

多核になっていても配列さえ同じなら大丈夫です．
まあ，白血病で異常な血球が増殖していたら別ですが・・・
本当に精密にやろうとしたら血球を分離した後白血球を不死化してそこから
DNA抽出，としないといけませんが，解析ならともかく診断にはそこまでは
必要ないでしょう．

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kaho