「地球シミュレータ後継機の計画、発表」記事へのコメント

活かしきれるのかな？

[Anonymous Coward]

10PFlopsですか。想像もつかない処理速度ですね。
しかし、現行の地球シミュレータなどを活かし切ったソフトウェアは開発されてるんですかね？
その辺りがかなり重要な気がする。

Re:活かしきれるのかな？

[Akami (4183)]

地球シミュのハードを生かすソフトウェアは、何よりも最適化の段階で
いろいろあるらしく。
http://www.ne.jp/asahi/comp/tarusan/main66.htm [www.ne.jp] あたり参照。

で、数十Tflopsで足りないアプリケーションなんてそこいら中に山の
ように転がってます。
とりあえずタンパク質のMD(分子動力学計算)を使った構造解析ですら、
所要時間の面でX線回折を使った方法とタメを張れるようになるには最低
1Pflopって言われてます。

＃MDにはMD-GRAPE使ったほうが安いんですけどね。

Re:活かしきれるのかな？

[yshibaya (16994)]

専門外の人間からの質問です．リンク先の終わりの部分に

>> プログラマが性能分析ツールを駆使して 直接コードをいじってベクトル化率・並列化率を上げるそうである

とあります．
このプログラマがコードを最適化する時間(日数)やこのプログラマを雇う人件費etcを考慮しても
地球シミュレータが目的としている分野の計算では圧倒的なパフォーマンス
(コスト，計算時間，やりたいことが実現できているかetc)を示すと思っていてよいのでしょうか?

Re:活かしきれるのかな？

[SteppingWind (2654)]

実際に多くのプログラムでは, 性能に影響する部分は全コードの1%にも満たない部分(多重ループの最も内側とか)であるか, あるいは逆に主要なアルゴリズム自体に問題があるかに大別できる場合がほとんどです.

ここで人手による最適化を行うのは前者ですね. ソフト的な面からはコンパイラが予想できないデータ(問題)の特性をコード内にヒントとして埋め込んで一層の最適化を進めたり, 既に最適化されたライブラリを使わせるようにします. ハード的な面からは, 昔はパイプラインを伸ばすためにループアンローリングさせたり, メモリバンクアクセスのバッティングを防ぐために配列サイズを奇数にしたりしましたけど. テストランできる環境(例えばSX-6i等)があれば, それほど大きな手間じゃないことが多いです.

後者のアルゴリズムの問題は小手先じゃどうしようもないですね. 分子動力学や多体問題なんかはGRAPEを使った方が良いですし, 問題が十分に疎ならばPCクラスタの方が有利でしょう. これらの手段も使えないとなると

• 最適化をあきらめてごり押し
• モデル化段階から再検討
• 数値解析自体をあきらめる

という選択です.

Re:活かしきれるのかな？

[Anonymous Coward]

最適化したコードは、繰り返し使うんじゃないのかな？
だから最初の一発が重要、と思うんだけど、違うのかな？

Re:活かしきれるのかな？

[Anonymous Coward]

リンク先、面白かったです(^^)

モデ権は持ってないのでＡＣ

Re:活かしきれるのかな？

[quabbin (17251)]

>「Power3はPowerPCをベースとし」(逆だろ)

プロセッサは良く知らないのですが、興味が出たので調べてみました。
IBMによるPOWER3の説明 [ibm.com]によると、「PowerPC 620のプロセッサコアを受け継ぎ」と書いてありますので、「Power3はPowerPCをベースとし」は問題ないようですね。
ただ、PowerPCの系譜 [ibm.com]によると、PowerPCはPOWER１をベースにしているように読み取れます。
3と1を間違えたのでしょうか？

Re:活かしきれるのかな？

[chiba-f (6867)]

うろ覚えですが．PowerPCは初代Powerのアーキテクチャをパソコン向けに設計し直したものです．初代Powerは，ひとつのCPUが複数のチップからなる高性能版，ひとつのチップからなる簡略版などのバリエーションがありました．初代PowerPCであるPowerPC 601はこの簡略版をベースにしたもので，PowerPCの一部の命令はマイクロコードで実装されていました．また，周辺チップとのインターフェースはモトローラのRISC CPU MC88000のものを流用していました．それで，601はPower 1からPowerPCへのブリッジと言われていました．

Re:活かしきれるのかな？

[myr (4629)]

よくわかんねっすけど、86系とかじゃなければ、一応「最新」と言われてるコンパイラでもそこまでガリガリ最適化してくれないチップ結構あると思いますが...
(そもそもCなんてほぼ動かんorコンパイラがバグってる、みたいなチップも多数あるし...)

Re:活かしきれるのかな？

[Anonymous Coward]

元の文章では「PC用コンパイラでは」と書いてますからまぁx86系と思っていいのではないかと。

Re:活かしきれるのかな？

[chocopa (14067)]

ＳＨ２のＦＦＴをＧＣＣで書いたら遅いんで
一からアッセンブラで組んだら劇的に早くなりましたよ。
こんな事例、いろんなＣＰＵでなんぼである。

コンパイラ後手動最適化どころか、手組が早い分野はまだまだあるよ。

Re:活かしきれるのかな？

[prankster (12979)]

オプティマイジング・コンパイラを使うよりインライン展開をガリガリ書いた方が速かったという経験があります。
＃MD法で水中のアミノ酸オリゴマーの3D形状計算。

コンパイラまかせじゃすまない部分はまだまだあります。

Re:活かしきれるのかな？

[Anonymous Coward]

900億の価値があるということでしょうか？

Re:活かしきれるのかな？

[Anonymous Coward]

正直、XRDのデータとか再現できないような気がするんですが...

Re:活かしきれるのかな？

[Anonymous Coward]

地球シミュレータはいろいろと使いづらいところがあったため
使い易いスパコンを目指すということを講演で聞きました。

そういうわけで、地球シミュレータが生かしきられているかはわかりませんけど、
後継機は処理能力を生かしきったソフトが開発されやすいような
土壌の整備も行うんじゃないでしょうか。

Re:活かしきれるのかな？

[Anonymous Coward]

一時間ぐらいSETIに貸してくれるだけで、
相当な量の計算が可能だな。
数分でdistributed.netの賞金も貰えそう

Re:活かしきれるのかな？

[YO1201 (17300)]

UDのほうを…